Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
BiyoinformatikEHM530237.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüSeçmeli @ Elektr.&Hab. Müh. ABD Elektronik&Haberleşme Mühendisliği Yüksek Lisans Programı (Tezsiz)
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimElektronik & Haberleşme Mühendisliği Bölümü
Dersin Koordinatörü
Dersi Veren(ler)
Asistan(lar)ıÖzden Niyaz, Hatice Vildan Düdükçü
Dersin AmacıBilgi teknolojileri, istatistik, mühendislik ve bilgisayar bilimlerinden yöntemler kullanarak, biyomedikal bilimlerde ortaya çıkan problemlere çözümler sunmaktır.
Dersin İçeriğiİşlemsel zeka ile gen sıralarının analizi, internette bulunması mümkün olan BLAST ve FASTA gibi işlemsel araç programlarının kullanımı ile DNA veritabanlarının, DNA mikrodizilerinin ve çiplerinin, biyomedikal ve diğer uygulamaların araştırılması ve kullanımı.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • David M. Mount, Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis, Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2001.
  • C.H. Wu, J.W. McLarty, Neural Networks and Genome Informatics, Elsevier, 2000.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler dizi analizi bilgisini kazanabileceklerdir.
  2. Öğrenciler yapay sinir ağlarını öğrenebileceklerdir.
  3. Öğrenciler yapay sinir ağları ile uygulama yapabileceklerdir.
  4. Öğrenciler Bayes sınıflama, karar ağaçları, k - ortalamalı kümeleme metodu ve k en yakın komşuluk metodunu öğrenebileceklerdir.
  5. Öğrenciler sunum yapma becerisi kazanabileceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-1-----
PÇ-2-----
PÇ-3-----
PÇ-4-----
PÇ-5-----
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-10-----
PÇ-11-----
PÇ-12-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Tarihçe ve GirişDers Kitabı 1 (Bölüm 1)
2Dizi AnaliziDers Kitabı 1 (Bölüm 2,3,4)
3BLAST ProgramıDers Kitabı 2 (Bölüm 2,3,4,5)
4Yapay Sinir Ağları (YSA)Ders Kitabı 2 (Bölüm 2,3,4,5)
5Yapay Sinir Ağları (YSA)Ders Kitabı 2 (Bölüm 2,3,4,5)
6Yapay Sinir Ağları (YSA)Ders Kitabı 2 (Bölüm 2,3,4,5)
7YSA nın Biyoinformatikte Kullanımı
8Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı
9LVQ Algoritması
10Bayes Sınıflandırma Metodu
11Karar Ağaçları
12K - Ortalamalı Kümeleme Metodu, K En Yakın Komşuluk Metodu, Destek Vektör Makineleri
13Öğrenci Sunumları
14Öğrenci Sunumları
15Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev220
Sunum/Jüri120
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati133
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması133
Derse Özgü Staj
Ödev220
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer140
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok