Anasayfa » Akademik Birimler » Fen-Edebiyat Fakültesi » Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü » Dersler » Proteomik
Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
ProteomikMBG611937.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiDoktora
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı
Seçmeli @ Biyoteknoloji ABD Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı
Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüEmel Ordu
Dersi Veren(ler)Şenay Vural Korkut, Nehir Özdemir Özgentürk, Emel Ordu
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu ders ile proteom ve proteomik kavramının çeşitli model organizmalar üzerinde karşılaştırmalı olarak öğrenilmesi; temel proteomik yöntemlerinin ve analiz yollarının örnek literatürler üzerinden tartışılması; tıp, ilaç, kozmetik, gıda ve benzeri biyoteknolojik uygulama alanlarında kullanımının kavranması amaçlanmaktadır.
Dersin İçeriğiProteomik dersi; proteom ve proteomik kavramlarına ve araştırmalara genel bakış, protein analizinde iki yönlü elektroforez (2-D), proteinlerin enzimatik parçalanması ve peptidlerin HPLC ile ayrılması, peptid ve proteinlerin dizi analizleri, proteom analizlerinde, kütle spektrometresi, biyoinformatik, Protein ekspresyon profilinin belirlenmesi, proteomik analizlerde model sistemler, proteomikte son gelişmeler ve uygulama alanlarını içermektedir.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Introduction to proteomics: tools for the new biology, Daniel C. Liebler, Humana Press, 2002
  • Introducing Proteomics: From concepts to sample preparation, mass spectrometry and data analysis, josip Lovric, Wiley-Blackwell, 2011
  • Intoduction to Proteomics: Principles and Applications (Methods of Biochemical Analysis), Nawin C.Mishra, Wiley, 2010
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Dersin sonunda öğrenciler proteom ve proteomik kavramlarını öğreneceklerdir.
  2. Öğrenciler birçok organizmanın farklı proteom çalışmaları hakkında bilgi sahibi olacaklardır.
  3. Öğrenciler proteinlerin yapı analizlerinde en son gelişmelerde kullanılan yöntemleri sorgulayabileceklerdir.
  4. Öğrenciler proteomik çalışmalarının biyoteknoloji ve farklı alanlardaki uygulamalarını öğreneceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4
PÇ-1----
PÇ-2----
PÇ-3----
PÇ-4----
PÇ-5----
PÇ-6----
PÇ-7----
PÇ-8----
PÇ-9----
PÇ-10----
PÇ-11----
PÇ-12----
PÇ-13----
PÇ-14----
PÇ-15----
PÇ-16----
PÇ-17----
PÇ-18----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Proteom ve Proteomik kavramlarına giriş, ökaryotik ve prokaryotik proteomDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
2Analitik proteomike genel bakışDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
3Analitik peptid ve protein saflaştırılmasıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
4Proteomikte deneysel stratejilere giriş, jel bazlı ayırıcı, protein/peptidlerin jelde görüntülenmesi, proteomik uygulamalarda çiplerDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
5Peptid ve protein analizleri için kütle spektrometresiDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
6“ Peptide Mass Fingerprinting” ile Protein tanımlanmasıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
7Tandem kütle spektrometre ile dizi analisi ve protein tanımlanmasıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
8Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı
9SALSA: Tandem MS bilgisinin spesifik özellikleri için bir algoritma Ders Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
10Proteomların incelenmesi, protein ekspresyon profilinin belirlenmesiDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
11Protein protein etkileşimlerinin ve protein komplekslerinin tanımlanmasıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
12Proteom modifikasyonlarının haritalanmasıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
13Proteomikte son gelişmeler, tıp alanında uygulamalarıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
14Proteomikte son gelişmeler, ilaç sektöründe uygulamalarıDers Kitabı I, II, III ve ilgili araştırma makaleleri
15Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri220
Projeler110
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması144
Derse Özgü Staj
Ödev120
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler120
Sunum / Seminer220
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok