Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
---|---|---|---|---|---|---|
Biyoinformatik Analizler | MBG6105 | 3 | 7.5 | 3 | 0 | 0 |
Önkoşullar | Yok |
---|
Yarıyıl | Güz |
---|
Dersin Dili | Türkçe |
---|---|
Dersin Seviyesi | Doktora |
Dersin Türü | Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı Seçmeli @ Biyoteknoloji ABD Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı |
Ders Kategorisi | Uzmanlık/Alan Dersleri |
Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
Dersi Sunan Akademik Birim | Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
---|---|
Dersin Koordinatörü | Nehir Özdemir Özgentürk |
Dersi Veren(ler) | Şenay Vural Korkut, Nehir Özdemir Özgentürk |
Asistan(lar)ı |
Dersin Amacı | Bu dersin amacı kompleks biyolojik sistemlerin analizi, nükleik asit ve protein dizi analizlerinin temellerini biyoinformatik araçlar kullanılarak uygulamalı olarak ögrencilerin öğrenmesini sağlamaktır. |
---|---|
Dersin İçeriği | Genomiks, GenBank Dizi Databankası, Dizi Birleştirme, Gen Tahmini konuları ve ilgili Programlar (NCBI's Entrez, BLAST, PSI-BLAST, ClustalW, Pfam, PRINTS, BLOCKS, CAP3, PHRAD Prosite and the PDB, ORF Finder,GENSCAN, SCOP & CATH) |
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Bu dersin sonunda öğrenciler, Sayısal Biyoloji ve Biyoinformatik hakkında temel kavramları öğrenir.
- Öğrenciler en yaygın kullanılan biyoinformatik programlarının kullanım alanları ve detayları hakkında bilgi sahibi olur.
- Öğrenciler en önemli bioinformatik programlarının kullanım tecrübesi edinir.
Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi
DÖÇ-1 | DÖÇ-2 | DÖÇ-3 | |
PÇ-1 | - | - | - |
PÇ-2 | - | - | - |
PÇ-3 | - | - | - |
PÇ-4 | - | - | - |
PÇ-5 | - | - | - |
PÇ-6 | - | - | - |
PÇ-7 | - | - | - |
PÇ-8 | - | - | - |
PÇ-9 | - | - | - |
PÇ-10 | - | - | - |
PÇ-11 | - | - | - |
PÇ-12 | - | - | - |
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
---|---|---|
1 | Gen ve Gentik Kodlar | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
2 | GenBank Dizi Data Bankası NCBI | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
3 | GenBank Dizi Data Bankası | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
4 | Dizi Birleştirme | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
5 | Coklu Dizi Birleştirme | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
6 | CAP3, PHRAD | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
7 | ClustalW ve Protein Analizi (Pfam, Prosite, Prints, Blocks) | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
8 | Ara Sınav 1 | |
9 | Data Bankası incelemesi BLAST analizi | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
10 | GENSCAN, PSI-BLAST | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
11 | ORF Finder | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
12 | Gen Ontoloji /MATLAB) | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
13 | Mikroarray Data Analizi | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
14 | Protein Data Bankası | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
15 | Protein Katlanmaları, SCOP ve CATH | Ders Kitabı 1 ve İlgili Araştırma Makaleleri |
16 | Final |
Değerlendirme Sistemi
Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
---|---|---|
Devam/Katılım | ||
Laboratuar | ||
Uygulama | ||
Arazi Çalışması | ||
Derse Özgü Staj | ||
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
Ödev | 1 | 10 |
Sunum/Jüri | 1 | 10 |
Projeler | ||
Seminer/Workshop | ||
Ara Sınavlar | 1 | 40 |
Final | 1 | 40 |
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
TOPLAM | 100 |
AKTS İşyükü Tablosu
Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
---|---|---|---|
Ders Saati | 14 | 3 | |
Laboratuar | |||
Uygulama | |||
Arazi Çalışması | |||
Sınıf Dışı Ders Çalışması | 14 | 4 | |
Derse Özgü Staj | |||
Ödev | 1 | 30 | |
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
Projeler | |||
Sunum / Seminer | 1 | 30 | |
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 30 | |
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 40 | |
Toplam İşyükü : | |||
Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
AKTS Kredisi : |
Diğer Notlar | Yok |
---|