| Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Protein Yapısı ve Mühendisliği | MBG5119 | 3 | 7.5 | 3 | 0 | 0 |
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Yarıyıl | Güz |
|---|
| Dersin Dili | Türkçe |
|---|---|
| Dersin Seviyesi | Doktora |
| Dersin Türü | Seçmeli @ Biyoteknoloji ABD Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı |
| Ders Kategorisi | Uzmanlık/Alan Dersleri |
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
| Dersi Sunan Akademik Birim | Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
|---|---|
| Dersin Koordinatörü | Emel Ordu |
| Dersi Veren(ler) | Şenay Vural Korkut, Nehir Özdemir Özgentürk, Emel Ordu |
| Asistan(lar)ı |
| Dersin Amacı | Tıp ve biyoteknoloji alanlarında kullanım amacıyla modifiye edilmiş proteinlerin tasarlanmasına temel oluşturacak protein yapı ve fonksiyon kavramlarının anlaşılması |
|---|---|
| Dersin İçeriği | Protein katlanması, dayanıklılığı ve fonksiyonu, istenilen amaca yönelik olarak protein yapı, fonksiyon ve dayanıklılığı değiştirilmiş mutantların geliştirilmesi, protein mühendisliği metodları. |
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
| Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Öğrenciler protein yapısının genel özelliklerini, ikincil yapıları, motifleri ve klasik 3 boyutlu yapıyı öğrenir.
- Öğrenciler protein çalışmalarında Ramachadran Diyagramı, X-ray Kristalografisi, NMR ve optik absorbans ölçümlerini öğrenir.
- Öğrenciler protein katlanma mekanizmalarını öğrenir.
- Öğrenciler Protein Mühendisliği tekniklerinin hakkında bilgi sahibi olur.
- Öğrenciler proteinlerin geliştirilmesinde protein mühendisliği yöntemlerinin kullanımı hakkında bilgi sahibi olur.
Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi
| DÖÇ-1 | DÖÇ-2 | DÖÇ-3 | DÖÇ-4 | DÖÇ-5 | |
| PÇ-1 | - | - | - | - | - |
| PÇ-2 | - | - | - | - | - |
| PÇ-3 | - | - | - | - | - |
| PÇ-4 | - | - | - | - | - |
| PÇ-5 | - | - | - | - | - |
| PÇ-6 | - | - | - | - | - |
| PÇ-7 | - | - | - | - | - |
| PÇ-8 | - | - | - | - | - |
| PÇ-9 | - | - | - | - | - |
| PÇ-10 | - | - | - | - | - |
| PÇ-11 | - | - | - | - | - |
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Protein Yapısının Genel Özellikleri, amino asit ve peptid yapısı ve özellikleri | Ders Kitabı 1 |
| 2 | ikincil ,üçüncül ve dördüncül yapılar | Ders Kitabı 1 |
| 3 | Protein Katlanması | Ders Kitabı 1 |
| 4 | Proteinlerin Optik Absorbans Ölçümleri | Ders Kitabı 1 |
| 5 | Biyofiziksel Metodlarla Protein KatlanmasınınTakip Edilmesi | Ders Kitabı 1 |
| 6 | Protein Mühendisliğinin Tanımlanması. İstenilen Özellikte Rekombinant Proteinlerin Geliştirilmesi. | Ders Kitabı 1 |
| 7 | Rasyonel Dizayn | Ders Kitabı 1 |
| 8 | Ara Sınav 1 | |
| 9 | Protein Katlanması Çalışmalarında Protein Mühendisliğinin Kullanılması | Ders Kitabı 1 |
| 10 | Küçük Proteinlerin Mühendisliği | Ders Kitabı 2 |
| 11 | Hastalıkların Tedavisinde Kullanılacak Immunoglobulinlerin Geliştirilmesi. | Ders Kitabı 2 |
| 12 | Protein Stabilitesinin Geliştirilmesinde Kullanılan Metodlar | Ders Kitabı 2 |
| 13 | Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Rekombinant Proteinlerin Izolasyonu. | Ders Kitabı 2 |
| 14 | Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Rekombinant Proteinlerin Izolasyonu. | Ders Kitabı 2 |
| 15 | De novo Protein Tasarlanması. | Ders Kitabı 2 |
| 16 | Final |
Değerlendirme Sistemi
| Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
|---|---|---|
| Devam/Katılım | ||
| Laboratuar | ||
| Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Derse Özgü Staj | ||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
| Ödev | 1 | 10 |
| Sunum/Jüri | 1 | 10 |
| Projeler | 1 | 20 |
| Seminer/Workshop | 1 | 10 |
| Ara Sınavlar | 1 | 10 |
| Final | 1 | 40 |
| Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
| Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
| TOPLAM | 100 | |
AKTS İşyükü Tablosu
| Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 13 | 3 | |
| Laboratuar | |||
| Uygulama | |||
| Arazi Çalışması | |||
| Sınıf Dışı Ders Çalışması | 13 | 4 | |
| Derse Özgü Staj | |||
| Ödev | 1 | 15 | |
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
| Projeler | 1 | 30 | |
| Sunum / Seminer | 2 | 15 | |
| Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 20 | |
| Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 40 | |
| Toplam İşyükü : | |||
| Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
| AKTS Kredisi : | |||
| Diğer Notlar | Yok |
|---|