Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
DNA Protein EtkileşimleriMBG510437.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiYüksek Lisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Yüksek Lisans Programı
Seçmeli @ Biyoteknoloji ABD Biyoteknoloji Yüksek Lisans Programı
Seçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik ABD Moleküler Biyoloji ve Genetik Doktora Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüŞenay Vural Korkut
Dersi Veren(ler)
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı protein DNA etkileşimlerinde önemli DNA yapılarının, protein DNA interaksiyonunun teorik temellerinin ve moleküler mekanizmasının, DNA ile etkileşen proteinlerin yapı ve fonksiyonlarının açıklanmasıdır.
Dersin İçeriğiA, B VE Z DNA yapıları, Proteinlerin DNA dizinleriyle etkileşiminin temelleri: majör ve minör oyuntu ve şeker-fosfat omurgasıyla etkileşim, Heliks-dönüş-heliks motifleri, beta motifleri ve spesifik örnekler, Lösin zipper motifleri ve örnekler, nükleazlar, DNA metilasyonu ve metilazlarla etkileşim, DNA polimerazlarla etkileşim, DNA topizomerazlarla etkileşim, prokaryotik topizomerazlar, Ökaryotik topizomerazlar, DNA rekombinasyon mekanizması, DNA helikazlar, Temel transkripsiyon faktörleriyle etkileşim, Aktivatör ve repressörlerle etkileşim, Protein-DNA etkileşimlerinin rekombinant DNA teknolojisi ve hastalıklar açısından önemi,
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • DNA-protein interactions Travers, A Chapman Hall 2000 ISBN: 0-19-963691-5
  • DNA-Protein Interactions A Practical Approach Travers A, Buckle M Oxford University Press (2000) ISBN 10:0-19-963691-5
  • Gene Regulation: An Eukaryotic Perspective, Latchman, D. S., Taylor and Francis Ltd, 2005.ISBN, 415365104
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler DNA protein etkileşimlerinde önemli yapıları ve bunların fonksiyonlarını kavrayacaktır.
  2. Öğrenciler hücredeki temel olaylarda bu etkileşimlerin rolleri hakkında bilgi sahibi olacaktır.
  3. Öğrenciler gen ekspresyonunun kontrolünde DNA-protein etkileşimlerinin önemini öğrenecektir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3
PÇ-1---
PÇ-2---
PÇ-3---
PÇ-4---
PÇ-5---
PÇ-6---
PÇ-7---
PÇ-8---
PÇ-9---
PÇ-10---
PÇ-11---
PÇ-12---
PÇ-13---
PÇ-14---
PÇ-15---
PÇ-16---
PÇ-17---
PÇ-18---

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1A, B VE Z DNA yapıları. Ders kitabı 1, 2, 3
2Proteinlerin DNA dizinleriyle etkileşiminin temelleri: majör ve minör oyuntu ve şeker-fosfat omurgasıyla etkileşimDers kitabı 1, 2, 3
3Heliks-dönüş-heliks motifleri, beta motifleri ve spesifik örneklerDers kitabı 1, 2, 3
4Lösin zipper motifleri ve örneklerDers kitabı 1, 2, 3
5Lösin zipper motifleri ve örneklerDers kitabı 1, 2, 3
6NükleazlarDers kitabı 1, 2, 3
7DNA metilasyonu ve metilazlarla etkileşimDers kitabı 1, 2, 3
8Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı
9DNA polimerazlarla etkileşimDers kitabı 1, 2, 3
10DNA topizomerazlarla etkileşim, prokaryotik topizomerazlarDers kitabı 1, 2, 3
11Ökaryotik topizomerazlar.Ders kitabı 1, 2, 3
12DNA rekombinasyon mekanizmasıDers kitabı 1, 2, 3
13DNA helikazlarDers kitabı 1, 2, 3
14Temel transkripsiyon faktörleriyle etkileşimDers kitabı 1, 2, 3
15Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev220
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması146
Derse Özgü Staj
Ödev210
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer18
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok