| Ders Adı | Kodu | Yerel Kredi | AKTS | Ders (saat/hafta) | Uygulama (saat/hafta) | Laboratuar (saat/hafta) |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Moleküler Biyoloji 2 | MBG3322 | 4 | 6 | 3 | 0 | 2 |
| Önkoşullar | Yok |
|---|
| Yarıyıl | Bahar |
|---|
| Dersin Dili | Türkçe |
|---|---|
| Dersin Seviyesi | Lisans |
| Dersin Türü | Zorunlu @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı |
| Ders Kategorisi | Uzmanlık/Alan Dersleri |
| Dersin Veriliş Şekli | Yüz yüze |
| Dersi Sunan Akademik Birim | Moleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü |
|---|---|
| Dersin Koordinatörü | Şenay Vural Korkut |
| Dersi Veren(ler) | Şenay Vural Korkut, Günseli Kurt Gür |
| Asistan(lar)ı |
| Dersin Amacı | Ökaryot ve prokaryotlarda gen anlatım mekanizmalarının öğretilmesi. |
|---|---|
| Dersin İçeriği | Prokaryot ve ökaryotlarda gen anlatımı; transkripsiyon, transkripsiyonu düzenleyen faktörler, mRNA’nın işlenmesi, genetik kod, translasyon ve translasyon sonrası modifikasyonlarla işlevsel protein üretimi. |
| Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar |
|
| Opsiyonel Program Bileşenleri | Yok |
Ders Öğrenim Çıktıları
- Dersin sonunda öğrenciler Transkripsiyon, gen regülasyonu, RNA işlenmesi, ve translasyonun mekanizmasını bilirler.
- Dersin sonunda öğrenciler genomik ve fonksiyonel genomikteki gelişmelerin bakış açımızı nasıl geliştirdiğini anlayabilirler.
- Dersin sonunda öğrenciler moleküler bilgilerini HIV retrovirüs ve insan hastalık durumlarının altında yatan bozuklukları gibi kompleks mekanizmaları anlamak ve bu konuda hipotez oluşturmak için kullanabilirler.
- Dersin sonunda öğrenciler gel shift, nuclear run-on ölçümleri, promotor linker tarama, analizi gibi standart moleküler tekniklerin kullanıldığı deney sonuçlarını yorumlayabilirler.
- Dersin sonunda öğrenciler klasik deneylerin, DNA replikasyonunu, rekombinasyonunu, transkripsiyonu ve gen regulasyonunu anlamada nasıl katkıda bulunduğunu açıklayabilirler.
Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi
| DÖÇ-1 | DÖÇ-2 | DÖÇ-3 | DÖÇ-4 | DÖÇ-5 | |
| PÇ-1 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| PÇ-2 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| PÇ-3 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| PÇ-4 | - | - | - | - | - |
| PÇ-5 | - | - | - | - | - |
| PÇ-6 | - | - | - | - | - |
| PÇ-7 | - | - | - | - | - |
| PÇ-8 | - | - | - | - | - |
| PÇ-9 | - | - | - | - | - |
| PÇ-10 | - | - | - | - | - |
| PÇ-11 | - | - | - | - | - |
| PÇ-12 | 5 | 5 | 5 | 5 | 5 |
| PÇ-13 | - | - | - | - | - |
| PÇ-14 | - | - | - | - | - |
| PÇ-15 | - | - | - | - | - |
| PÇ-16 | - | - | - | - | - |
| PÇ-17 | - | - | - | - | - |
| PÇ-18 | - | - | - | - | - |
Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları
| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|---|---|
| 1 | Prokaryotlarda gen anlatımı/ Lab. gruplarının oluşturulması, uygulamaların tanıtımı | Ders Kitabı 1, Bölüm 26/ |
| 2 | Ökaryotlarda gen anlatımı/Bitkiden total protein izolasyonu | Ders Kitabı 1, Bölüm 28/ |
| 3 | Prokaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri/Protein çözeltisinin konsantre edilmesi (amonyum sülfat çöktürmesi, ultrafiltrasyon) | Ders Kitabı 1, Bölüm 19/ |
| 4 | Prokaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri/Rekombinant proteinlerin afinite özelliklerinden yararlanarak saflaştırılması | Ders Kitabı 1, Bölüm 19/ |
| 5 | Ökaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri/Warburg – Christian yöntemi ile protein miktar tayini | Ders Kitabı 1, Bölüm 20/ |
| 6 | Ökaryotlarda temel transkripsiyon mekanizmasının oluşumu, farklı uyaranlarla aktivasyon ve baskılama, transkripsiyon faktörleri/ Doğal olmayan (denatüre) poliakrilamid jel elektroforezi (sds-page) (Solüsyonların hazırlanması) | Ders Kitabı 1, Bölüm 20/ |
| 7 | RNA’nın işlenmesi | Ders Kitabı 1, Bölüm 21/ |
| 8 | Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı | |
| 9 | mRNA Stabilitesi ve Lokalizasyonu /Doğal olmayan (denatüre) poliakrilamid jel elektroforezi (sds-page) (Yükleme-yürütme-yorumlama) | Ders Kitabı 1, Bölüm 22/ |
| 10 | Katalitik RNA ve Düzenleyici RNA /Doğal poliakrilamid jel elektroforezi – zimogram analizi | Ders Kitabı 1, Bölüm 23,30/ |
| 11 | Genetik kod/ Western blotlama-I | Ders Kitabı 1, Bölüm 25 |
| 12 | Prokaryotlarda translasyon, tRNA, ribozomlar ve düzenleyici proteinlerin yapı ve fonksiyonları/ Western blotlama-II | Ders Kitabı 1, Bölüm 24/ |
| 13 | Ökaryotlarda translasyon, tRNA, ribozomlar ve düzenleyici proteinlerin yapı ve fonksiyonları/Telafi deneyleri | Ders Kitabı 1, Bölüm 24/ |
| 14 | Translasyonun ardından işlevsel bir protein oluşması için gerekli işlemler /Telafi deneyleri | Ders Kitabı 1, Bölüm 24/ |
| 15 | Final |
Değerlendirme Sistemi
| Etkinlikler | Sayı | Katkı Payı |
|---|---|---|
| Devam/Katılım | ||
| Laboratuar | 1 | 30 |
| Uygulama | ||
| Arazi Çalışması | ||
| Derse Özgü Staj | ||
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | ||
| Ödev | ||
| Sunum/Jüri | ||
| Projeler | ||
| Seminer/Workshop | ||
| Ara Sınavlar | 1 | 30 |
| Final | 1 | 40 |
| Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı | ||
| Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı | ||
| TOPLAM | 100 | |
AKTS İşyükü Tablosu
| Etkinlikler | Sayı | Süresi (Saat) | Toplam İşyükü |
|---|---|---|---|
| Ders Saati | 14 | 2 | |
| Laboratuar | 14 | 2 | |
| Uygulama | |||
| Arazi Çalışması | |||
| Sınıf Dışı Ders Çalışması | 14 | 2 | |
| Derse Özgü Staj | |||
| Ödev | 2 | 15 | |
| Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği | |||
| Projeler | |||
| Sunum / Seminer | 1 | 3 | |
| Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 30 | |
| Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi) | 1 | 40 | |
| Toplam İşyükü : | |||
| Toplam İşyükü / 30(s) : | |||
| AKTS Kredisi : | |||
| Diğer Notlar | Yok |
|---|
