Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Biyokimya 2MBG331235300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüZorunlu @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüBanu Mansuroğlu
Dersi Veren(ler)Banu Mansuroğlu, Kadriye Kızılbey
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı, öğrencilerin biyolojik moleküllerin sentez ve yıkım metabolizmalarını moleküler düzeyde anlamalarını sağlamaktır. Metabolik yolların işleyişini, düzenlenmesini ve organizma düzeyindeki etkilerini kavrama becerisi kazandırmaktır. Öğrencilere, metabolik bozuklukların biyokimyasal temellerini açıklama, farklı metabolik yolaklar arasındaki bağlantıları yorumlama ve metabolik değişiklikleri analiz etme yetkinliği kazandırmaktır. Edinilen bilgileri kullanarak disiplinlerarası çalışmalarda biyokimyasal verileri değerlendirebilme, çözüm odaklı hipotez geliştirebilme ve alanında bilimsel problem çözme becerisi geliştirmektir.
Dersin İçeriğiKarbonhidrat, lipid, protein ve nükleik asit metabolizmalarının sentez ve yıkım süreçlerini kapsar. Enzimatik reaksiyon mekanizmaları, enerji dönüşümleri, metabolik yolakların düzenlenmesi ve entegrasyonu, metabolik yolların hücre içi ve hücreler arası koordinasyonu, hormonal ve allosterik kontrol mekanizmaları. Metabolik hastalıkların biyokimyasal temelleri, klinik örnekler ve laboratuvar bulguları.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • A.L.Lehninger, D.L. Nelson, M.M. Cox; W.H. Freeman, Lehninger Biyokimyanın İlkeleri, Ç.Ed.: Y. Murat Elçin, Palme 2013.
  • J.M.Berg, J.L. Tymoczko, L. Stryer, Biyokimya (Strayer) , Palme Yayıncılık, 2008.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Bu dersi başarıyla tamamlayan öğrenciler, Biyoenerjetik ilkelerini açıklayabilecek, biyolojik enerji dönüşümlerini değerlendirebileceklerdir.
  2. Karbonhidratların yıkım ve sentez reaksiyonlarını tanımlayabilecek ve bu süreçlerin düzenlenmesini analiz edebileceklerdir.
  3. Lipidlerin yıkım ve sentez reaksiyonlarını açıklayabilecek ve enerji metabolizmasındaki rollerini yorumlayabileceklerdir
  4. Proteinlerin ve amino asitlerin yıkım ve sentez reaksiyonlarını açıklayabilecek ve bu süreçlerin metabolik entegrasyonunu değerlendirebileceklerdir.
  5. Nükleik asitlerin yıkım ve sentez reaksiyonlarını tanımlayabilecek ve bu süreçlerin hücresel işlevlerle ilişkisini yorumlayabileceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-155555
PÇ-2-----
PÇ-3-----
PÇ-4-----
PÇ-555555
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-10-----
PÇ-11-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Konu Anlatımı (%85): Bu ders kapsamında, metabolik düzenleme ve ilkleri, metabolik denetimin çözümlenmesi konularına genel bakış yapılacak Sınıf içi uygulama (%15): Hücre ve organellerin dinamik kararlı halleri, enzim miktarları ve katalitik aktiflik, hücrelerdeki dengeden uzak tepkimeler hakkında genel değerlendirmeMetabolizmanın Genel İlkeleri okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 14.
2Konu Anlatımı (%85): Glikoliz ve glukoneogenezin eşgüdümlü düzenlenmesi tepkimeleri Sınıf içi uygulama (%15): Glikolizin basamakları, glikolizi besleyen basamaklar, anaerobik koşullarda piruvatın akibeti, etanol fermentasyonları, glukoneogenezin basamaklarıGlikoliz, Glikoneogenez Tepkimelerinin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 15.
3Konu Anlatımı (%85): Pentoz fosfat yolu basamakları Sınıf içi uygulama (%15): Glikoz oksidasyonunda pentoz fosfat yolağıPentoz Fosfat Ağı tepkimelerinin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 15.
4Kısa sınav : 1,2 ve 3 konuları ile ilgili Konu Anlatımı (%85):Glikojen metabolizması, ve sitrika sit siklüsü basamakları Sınıf içi uygulama (%15): Hayvanlarda glikojen metabolizması, glikojen sentezi ve yıkımı, sitrik asit çevrimi ve tepkimeleriSitrik Asid Döngüsü ve Glikojen metabolizmasının okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 16. Kısa sınav1 : (1,2 ve 3 konuları ile ilgili) Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 14,15 ve 16.
5Konu Anlatımı (%85): Karbonhidrat metabolizmasının düzenlenmesi Sınıf içi uygulama (%15): Glikoliz ve glukoneogenezin eşgüdümlü düzenlemesi, sitrik asit çevriminin düzenlenmesi, diyetle alınan karbonhidratların metabolizmasıKarbonhidrat Metabolizmasının regülasyonu ve Diyetle alınan karbonhidratların metabolizmasının okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 20.
6Konu Anlatımı (%85):Yağ asitlerinin oksidasyon basamakları Sınıf içi uygulama (%15): Yağların sindirimi ve serbest bırakılması, yağ asitlerinin oksidasyonu, keton cisimleriYağ asiti yıkımı konusunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 17.
7Kısa sınav : 4,5 ve 6 konuları ile ilgili Konu Anlatımı (%85):Lipid biyosentezi basamakları anlatımı Sınıf içi uygulama (%15):Yağ asitlerinin ve eikosanoitlerin biyosentezi, triaçilgliserol biyosentezi ayrıntılı basamakları Lipid Biyosentezi basamakları ve Triaçilgliserollerin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 21. Kısa sınav 2 : (4,5 ve 6 konuları ile ilgili) Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 16, 17 ve 20.
8Ara Sınav 1
9Konu Anlatımı (%85): Zar fosfolipidlerinin biyosentez basamakları, Kolesterol biyosentezi Sınıf içi uygulama (%15): Zar fosfolipitlerin biyosentez basamakları, plazmalojen sentezi, sfingolipid ve gliserofosfolipid sentezi, kolesterol steroit, ve izoprenoitlerin biyosentezi Zar fosfolipidleri ve kolesterol konusunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 21.
10Konu Anlatımı (%85):Diyetle alınan lipidlerin metabolizması, Sınıf içi uygulama (%15): Diyetle alınan lipidlerin sindirimi, emilimi, salgılanması ve emilimi, diyetle alınan lipidlerin ince bağırsakta emülsifikasyonu, bağırsak mukoza hücrelerinden lipidlerinin salgılanması,i Plazma lipoproteinlerinin bileşimi, şilomikronlar ve LDL, HDL, VLDL IDL proteinlerin üretim ve kullanım döngüleriDiyetle alınan lipidlerin metabolizması ve Lipoproteinlerin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 21.
11Kısa sınav : 7,9 ve 10 konuları ile ilgili Konu Anlatımı (%85):Lipid metabolizmasının düzenlenmesi, Sınıf içi uygulama (%15): Lipid metabolizmasının hormonlar ile düzenlenmesi, allosterik enzimler ile düzenlenmesi, protein kinazlarla düzenlenmesiLipid Metabolizmasının Regülasyonu. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 21. Kısa sınav 3 : (7, 9 ve 10 konuları ile ilgili) Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 21.
12Konu Anlatımı (%85): Amino asit yükseltgenme basamakları Sınıf içi uygulama (%15): Amino Asitlerden azotun uzaklaştırılması, azot metabolizması, amino asit havuzu ve protein turnoverı ,ubikitin proteiozam mekanizması, diyetle alınan proteinlerin metabolizmasıAminoasitlerin Nükleotidlerin ve İlişkili Moleküllerin Biyosentezinin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 18, 22.
13Konu Anlatımı (%85): Amino asitlerden azotun uzaklaştırılması için gerçekleşen metabolik basamaklar Sınıf içi uygulama (%15): Transaminasyon ve glutamat dehidrogenaz basamakları, üre döngüsü ve azot metabolizmasıAminoasitlerin Azot atomunun uzaklaştırılmasının okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 22.
14Kısa sınav : 10,11 ve 12 konuları ile ilgili Konu Anlatımı (%85): Amino asit sentez ve yıkımı, aminoasitlerin özelleşmiş ürünlere dönüşümü Sınıf içi uygulama (%15): Glikojenik ve ketojenik aminoasitler, aminoasitlerin karbon iskeletinin katabolizması, aminoasit metabolizmasında folik asitin görevi, esansiyel olmayan amino asitlerin biyosentezi, Porfirin metabolizması, hem biyosentezi, hem yıkımı, katekolaminler, histamin, serotonin ve kreatin gibi azot taşıyan bileşiklerAminoasitlerden Türeyen Moleküllerin okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 22. Kısa sınav 4 : (11, 912ve 13 konuları ile ilgili) Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 18, 21 ve 22.
15Konu Anlatımı (%85): Nukleotid katabolizmasına ait basamaklar Sınıf içi uygulama (%15): Purin nükleotidlerinin sentezi, deoksiribonükleotidlerin sentezi, pürin nükleotidlerinin yıkılımı, pirimidin sentezi ve yıkılımıDNA ve RNA Metabolizmasının okunması. Kaynak: Ders Kitabı, Bölüm 25 ve 26.
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği420
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar140
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği42
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok