| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|
| 1 | Konu Anlatımı: Biyoinformatik Nedir? Biyoinformatik kullanım alanları Sınıf içi Tartışma: Tanılar ve kullanım alanları ile ile ilgili öğrenciler ile tartışması | Biyoinformatik Alanları için ön okuma. Kaynak: Ders Kitabı 1, 2. |
| 2 | Konu Anlatımı: Moleküler Veri Depolama ve işleme Sınıf İçi Uygulama: Web sayfalarının web üzerinden tanıtılması | Database Web sayfalarının İncelenmesi |
| 3 | Konu Anlatımı: Makale tarama/ uygulaması Sınıf İçi Uygulama: Web sayfaları üzerinden tarama örneklerinin yapılması | Makale Tarama. Kaynak: Pubmed, Scopus, Google Scholar sayfaları. |
| 4 | Konu Anlatımı: Nükleotid veri tabanları Sınıf İçi Uygulama: NCBI veri tabanının web üzerinden tanıtılması | Nükleotid veri sayfasının incelemesi Kaynak: NCBI web sayfası. |
| 5 | Konu Anlatımı: Protein veri tabanları Sınıf İçi Uygulama: Protein veri tabanlarının tanıtılması | Protein veri tabanlarının incelenmesi Kaynak: PDB, UniProt web sayfaları. |
| 6 | Konu Anlatımı: BLAST ile dizi benzerliği sorgulama Sınıf İçi Uygulama: BLAST uygulamasının yapılması | BLAST uygulamasının incelenmesi Kaynak: NCBI BLAST web sayfası. |
| 7 | Konu Anlatımı: BLAST ile dizi benzerliği sorgulama Sınıf İçi Uygulama: BLAST uygulamasının yapılması | BLAST uygulamasının incelenmesi Kaynak: NCBI BLAST web sayfası. |
| 8 | Ara Sınav 1 | |
| 9 | Konu Anlatımı: Çoklu Dizi Hizalama Sınıf içi uygulama: MSA örneği yapılması | MSA örneklerinin incelenmesi Kaynak: NCBI web sayfası. |
| 10 | Konu Anlatımı: Genom Dizileme Sınıf içi uygulama: Genom dizileme metotları anlatılması | DNA dizileme metotlarının ön incelenmesi. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 4. |
| 11 | Konu Anlatımı: Genom anotasyonu Sınıf içi uygulama: Gen, ekzon intron bölgeleri bulma gibi genom dizi örneklerini incelemesi | Genomun yapısal ve işlevsel analizleri ön okuması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 6. |
| 12 | Konu Anlatımı: Genom anotasyonu Sınıf içi uygulama: Genom dizisi örneklerinden fonksiyon analizleri incelenmesi | Genomun yapısal ve işlevsel analiz örneklerinin incelenmesi. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 6. |
| 13 | Konu Anlatımı: Primer tasarımı Sınıf içi Uygulama: Primer dizayn örnekleri yapılması | Primer tasarımı ile ilgili araştırma yapılması. |
| 14 | Konu Anlatımı: DNA motifi tayin algoritmaları Sınıf içi uygulama: DNA motif okumalarının ve tayinin analizlerinin incelenmesi ve uygulama örneklerinin gösterilmesi | DNA motif ve tayinin analizleri ile ilgili araştırma yapılması. |
| 15 | Konu Anlatımı: Çevrimiçi biyoinformatik araçlar Sınıf İçi Uygulama: Bazı programların web sayfalarından kullanım amaçları ve şekli gösterilmesi | Listede verilen biyoinformatik araçların web üzerinden incelenmesi. Kaynak: Güncel web sayfası listesi her dönem öğrenci ile paylaşılacaktır. |
| 16 | Final | |
