| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|
| 1 | Konu Anlatımı: Protein Yapısının Temeli; Proteinlerde Birincil Yapı ve Amino Asitlerin yapı ve özellikleri | 1. Proteinleri oluşturan primer yapı taşları olan amino asitlerin yapı ve özelliklerinin gözden geçirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 3. |
| 2 | Konu Anlatımı:Protein Yapısının Genel Özellikleri; İkincil Yapılar; proteinlerdeki düzenli ve düzensiz ikincil apıların genel özellikleri | 1. Proteinlerde birincil ve ikincil yapı özelliklerinin gözden geçirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 4. |
| 3 | Konu Anlatımı:Protein Yapısının Genel Özellikleri; Üçüncül ve Dördüncül Yapılar, Motif–Domain Kavramları ve Proteinlerin 3B Sınıflandırılması Kısa Sınav 1: Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması | 1. Proteinlerde 3 boyutlu yapı özelliklerinin ve sınıflandırmanın gözden geçirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı 1, Bölüm 4. 2. Kısa Sınav 1 için ön hazırlık: 1 ve 2. hafta işlenen konuların tekrar edilmesi |
| 4 | Konu Anlatımı: Protein Fonksiyonları; Geri dönüşümlü ligand bağlanması; oksijen taşınması, hemoglobin ve miyoglobin örneği | 1. Hemoglobin ve miyoglobin fonksiyonunun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 1, Bölüm 5.1; Bilimsel literatür |
| 5 | Konu Anlatımı: Protein Fonksiyonları, Proteinler ve Ligandlar Arasındaki Tamamlayıcı Etkileşimler; immun yanıtta proteinlerin görevleri ve immunoglobin örneği | 1. İmmunoglobin fonksioynunun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 1, Bölüm 5.2; Bilimsel literatür |
| 6 | Konu Anlatımı: Protein Fonksiyonları; Kimyasal Enerji ile Düzenlenen Protein Etkileşimleri; motor proteinler ve kas kasılması örneği. Kısa Sınav 2: Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması | 1. Motor proteinler ve kas kasılmasında protein fonksiyounun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 1, Bölüm 5.3; Bilimsel literatür. 2. Kısa Sınav 2 için ön hazırlık: 4 ve 5. hafta işlenen konuların tekrar edilmesi |
| 7 | Konu Anlatımı: Protein katlanma kavramı ve önemi Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi | 1. Protein katlanma modellerinin gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 2, Bölüm 10; Bilimsel literatür. |
| 8 | Ara Sınav 1 | |
| 9 | Konu Anlatımı: In vitro protein katlanma mekanizmaları ve kinetik/termodinamik prensipler, protein-ligand etkileşimleri Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi | 1. In vitro protein katlanma mekanizmalarının gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 4, 29-59; Bilimsel literatür. |
| 10 | Konu Anlatımı: In vivo protein katlanması; şaperon proteinlerin önemi Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi Kısa Sınav 3: Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması | 1. In vivo protein katlanması yollarının gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 3 , Bölüm 7.2; Bilimsel literatür . 2. Kısa Sınav 3 için ön hazırlık: 7 ve 9. hafta işlenen konuların tekrar edilmesi |
| 11 | Konu Anlatımı: Hatalı protein katlanmaları ve biyolojik etkileri; Nörodejeneratif hastalıklar Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi | 1. Hatalı protein katlanmaları ve nörodejeneratif hastalıkların gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 4, 223-261, 263-299, Bilimsel literatür |
| 12 | Konu Anlatımı: Hatalı protein katlanmaları ve biyolojik etkileri; Prion proteinler Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi Kısa Sınav 4: Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması | 1. Hatalı protein katlanmaları ve prion proteinler konusunun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 4, 191-222, Bilimsel literatür. 2. Kısa Sınav 4 için ön hazırlık: 10 ve 11. hafta işlenen konuların tekrar edilmesi |
| 13 | Konu Anlatımı: Amino asid biyosentezi Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi | 1. Amino asid biyosentezi konusunun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 1, Bölüm 20.1-2-3, Bilimsel Literatür |
| 14 | Konu Anlatımı: Amino asit biyosentezi ve ilgili hastalıklara moleküler biyolojik yaklaşımlar Sınıf-içi Tartışma: Güncel literatür bilgisi ile konunun öneminin pekiştirilmesi Kısa Sınav 5: Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması | 1. Amino asid biyosentezi konusunun gözden geçirilmesi. Kaynaklar: Ders Kitabı 1, Bölüm 20.1-2-3, Bilimsel Literatür 2. Kısa Sınav 5 için ön hazırlık: tüm haftalarda işlenen konuların tekrar edilmesi |
| 15 | Konu Anlatımı: Genel tekrar, tartışma ve güncel araştırmalar Sınıf-içi Tartışma: Protein kimyası ve katlanması araştırmalarının biyoteknolojideki yeri | 1. Öğrenilen tüm konularla ilgili bilimsel literatürün taranması. KaynakBilimsel literatür |
| 16 | Final | |
