Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Biyoorganik KimyaMBG307235300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüZerrin Zerenler Çalışkan
Dersi Veren(ler)Zerrin Zerenler Çalışkan
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı, canlı kimyasında geçen biyolojik öneme sahip biyomoleküllerin sentezinin anlaşılmasını ve, yaygın biyolojik kimyasal reaksiyonların açıklanarak, metabolik reaksiyonları katalize eden enzimlerin reaksiyonlarının derinlemesine kavranmasını sağlamaktır.
Dersin İçeriğiBiyoorganik Kimyada Genel Mekanizmalar, Biyomoleküller, Steriyokimya ve Kiralite, Diasteriomerler, Epimerler ve Mezo Bileşikler, Karbonhidratlarda Steriyokimya , Proksimiti Etkisi ve Moleküler Adaptasyon, Süpramolekuler Yapılar, Amino Asitler ve Peptidlerde Biyoorganik Kimya, Biyokimyasal Transformasyon, Alpha Amino Asitlerin Asimetrik Sentezi, Antikorlar olarak Enzimler Moleküler Tanımlama ve İlaç Tasarımı, Fosfat Gruplarının ve Polinükleotidlerin Biyoorganik Kimyası
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Dugas, H. Bioorganic Chemistry: A Chemical Approach to Enzyme Action 2nd Edition, Springer, 2012.
  • Balcı, M. Reaksiyon Mekanizmaları 1st Edition, TÜBA Ders Kitapları, Ankara, 2008.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Biyoorganik moleküller hakkında bilgi edinebileceklerdir.
  2. Biyoorganik moleküllerin sentezlerini ve reaksiyonlarını öğrenebileceklerdir.
  3. Biyolojik yapılardaki organik- kimyasal araştırmaları, sentezleri ve kinetik reaksiyonları anlayabileceklerdir.
  4. Biyoorganik Kimyanın güncel hayatımızdaki önemini kavrayabileceklerdir.
  5. Biyoorganik kimya ile moleküler biyoloji ve genetik alanı arasında bağlantı kurabileceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Konu Anlatımı: Biyoorganik Kimyada Genel Mekanizmalar Sınıf içi Tartışma : Konu anlatmı sonunda, reaksiyon mekanizmalarını ve çok farklı reaksiyonlarda gözlenen ortak noktaları anlamaya yönelik sınıf içi tartışma (15 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 2, Organik Kimyada reaksiyon Mekanizmaları.
2Konu Anlatımı: Biyomolekuller Sınıf içi Tartışma: Biyolojik Kimya ile Biyo-Organik Kimya Arasındaki Fark Nedir? konulu tartışma (15 dk) İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Biyomoleküler.
3Konu Anlatımı: Steriyokimya ve Kiralite Sınıf içi Tartışma: Enantiomerlerin biyolojik etkisi ve insan metabolizmasına etkisinin tartışılması (15 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 2, Steriyokimya ve Kiralite
4Konu Anlatımı: Diasteriomerler, Epimerler ve Mezo Bileşikler Sınıf içi Tartışma: Diasteriomerler, Epimerler ve Mezo Bileşiklerin ilaç sanayiindeki öneminin tartışılması (15 dk).İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 2, Diasteriomerler, Epimerler ve Mezo Bileşikler.
5Konu Anlatımı:Karbonhidratlarda Steriyokimya Sınıf içi Tartışma: karbonhidratlarda steriyokimyanın önemi (5 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 2, Karbonhidratlarda Steriyokimya.
6Konu Anlatımı:Proksimiti Etkisi ve Moleküler Adaptasyon Sınıf içi Tartışma: Moleküler adaptasyonda rproksimiti etkisinin öneminin tartışılması (15 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Proksimiti Etkisi ve Moleküler Adaptasyon
7Konu Anlatımı: Süpramolekuler Yapılarİlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Süpramolekuler Yapılar
8Ara Sınav 1
9Konu Anlatımı: İlaçlarda yaı Aktivite ilişkileri Sınıf içi Tartşma: Literatürdeki ve uygulamadaki örneklerin ve eksiklerin tartışılması (60 dk)Konu ile ilgili literatürlerin derlenmesi.
10Konu Anlatımı:Biyokimyasal Transformasyon Sınıf içi Tartışma: Biyokimyasal Transformasyonun metabolik reaksiyonlardakş etkisi (45 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Biyokimyasal Transformasyon
11Konu Anlatımı: Alpha Amino Acidlerin Asimetrik Sentezi İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Alpha Amino Acidlerin Asimetrik Sentezi
12Konu Anlatımı: Antikorlar olarak Enzimler Sınıf içi Tartışma: Konu ile ilgili son gelişmelerin literatürdeki örneklerinin tartışılması (45 dk) İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Antikorlar olarak Enzimler, son yıllara ait Literatürler
13Konu Anlatımı: Moleküler Tanımlama ve İlaç Tasarımı Sınıf içi Tartışma: Konu ile ilgili son gelişmelerin literatürdeki örneklerinin tartışılması (45 dk)İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Moleküler Tanımlama ve İlaç Tasarımı, son yıllara ait Literatürler
14Konu Anlatımı:Amino Asitler ve Peptidlerde Biyoorganik Kimyaİlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Amino Asitler ve Peptidlerde Biyoorganik Kimya
15Konu Anlatımı: Fosfat Gruplarının ve Polinükleotidlerin Biyoorganik Kimyası Sınıf içi Tartışma: Konu ile ilgili son gelişmelerin literatürdeki örneklerinin tartışılması (45 dk) İlgili konunun okunması. Kaynak: Ders Kitabı 1, Fosfat Gruplarının ve Polinükleotidlerin Biyoorganik Kimyası
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri240
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar120
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması144
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer26
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)110
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok