Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Bitki Moleküler BiyolojisiMBG441135300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüZorunlu @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüSevgi Maraklı
Dersi Veren(ler)Sevgi Maraklı
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu dersin amacı, öğrencilerin bitki büyümüme ve gelişimindeki moleküler mekanizmalar hakkında bilgi almalarını sağlamaktır. Ders aynı zamanda, bitkilerdeki epigenetik mekanizmalara ilişkin bilgi vererek moleküler ve epigenetik mekanizmalar arasındaki ilişkinin anlaşılma becerisini kazandırmayı amaçlamaktadır.
Dersin İçeriğiNükleus genomu, kloroplast ve mitokondri genomu, transpozonlar, bitkilere gen transferinde kullanılan doğrudan yöntemler, bitkilere gen transferinde kullanılan dolaylı yöntemler (Agrobacterium tumefaciens ve Ti plazmidi), bitki hormonları, bitki büyüme ve gelişmesinde rol oynayan epigenetik faktörler, patojenite ve bitki savunması (fitopatoloji), GDO’lu bitkiler.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Jones, R., Ougham, H., Thomas, H., & Waaland, S. (2012). Molecular Life of Plants. Wiley-Blackwell.
  • Buchanan, B. B., Gruissem, W., & Jones, R. L. (Eds.). (2015). Biochemistry and Molecular Biology of Plants. John Wiley & Sons.
  • Fedoroff, N. V. (Ed.). (2013). Plant Transposons and Genome Dynamics in Evolution. John Wiley & Sons.
  • Gallusci, P., Bucher, E., & Mirouze, M. (2018). Plant Epigenetics Coming of Age For Breeding Applications (Vol. 88). Academic Press.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Bitkilerde bulunan nükleer, mitokondri ve kloroplast genomları aralarındaki interaksiyonları yorumlayabileceklerdir.
  2. Bitki büyüme ve gelişimi ile ilgili moleküler ve epigenetik faktörler arasındaki ilişkiyi anlayacaklardır.
  3. Rekombinant DNA teknolojisinde bitkilerin kullanımı ile ilgili bilgi sahibi olacaklardır.
  4. Bitki hormonlarının görevlerini ve hormonlar arasındaki ilişkiyi anlayacaklardır.
  5. Bitki ve bitki patojenleri arasındaki moleküler ilişki ve bitki savunma mekanizmalarını analiz edeceklerdir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Konu Anlatımı: Nükleus genomu Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Derste anlatılan temel kavramlar ile ilgili örnekler verilerek tartışmanın yapılması Bitki nükleus genomu ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
2Konu Anlatımı: Kloroplast ve mitokondri genomları Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Bitkilerde bulunan farklı genomların karşılaştırılarak tartışılması Kısa Sınav 1 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Bitki kloroplast ve mitokondri genomlarının özelliklerinin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar. Kısa Sınav 1: (Kloroplast ve mitokondri) Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
3Konu Anlatımı: Yeni nesil DNA dizileme yöntemleri Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): İkinci ve üçüncü nesil DNA dizileme yöntemlerinin karşılaştırılarak tartışımasıFarklı dizileme yöntemleri ile ilgili bilgilerin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
4Konu Anlatımı: Bitki genom veri tabanlarının incelenmesi Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Veri tabanlarından veri nasıl çekileceğine ve bu veriler kullanılarak nasıl analiz yapılacağına ilişkin tartışmanın yapılmasıVeri tabanı ve veri tabanı kullanımına ilişkin kavramların uygulamalı şekilde gösterilmesi. Kısa Sınav 2: (Veri tabanları).
5Konu Anlatımı: Hareketli DNA Elementleri Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Hareketli DNA elementlerinin işlevlerinin örnekler verilerek tartışılması DNA transpozonları ve retrotranspozonlar ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
6Konu Anlatımı: Bitkilere gen transferinde kullanılan doğrudan yöntemler Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Rekombinant bitkilerin üretiminde kullanılan yöntemlerin örnekler verilerek tartışılması Kısa Sınav 2 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Avantaj ve dezavantajları ile birlikte gen aktarımınında kullanılan yöntemlerin özelliklerinin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar. Kısa Sınav 3: (Yöntemler) Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
7Konu Anlatımı: Bitkilere gen transferinde kullanılan doğrudan yöntemler Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Rekombinant bitkilerin üretiminde kullanılan yöntemlerin örnekler verilerek tartışılması Kısa Sınav 3 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Avantaj ve dezavantajları ile birlikte gen aktarımınında kullanılan yöntemlerin özelliklerinin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
8Ara Sınav 1
9Konu Anlatımı: Bitkilere gen transferinde kullanılan dolaylı yöntemler (Agrobacterium tumefaciens ve Ti Plazmidi) Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Agrobakterinin kullanım alanlarının örnekler verilerek tartışılması 1. Doğal bir genetik mühendis olan Agrobakteri ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.Doğal bir genetik mühendis olan Agrobakteri ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
10Konu Anlatımı: Bitkilere gen transferinde kullanılan dolaylı yöntemler (Agrobacterium tumefaciens ve Ti Plazmidi) Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Agrobakterinin kullanım alanlarının örnekler verilerek tartışılması Kısa Sınav 4 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Doğal bir genetik mühendis olan Agrobakteri ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar. Kısa Sınav 4: (A. tumefaciens) Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
11Konu Anlatımı: Bitki hormonları Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Hormonların işlevlerinin örnekler verilerek tartışılmasıHormon yapılarının ve hormonların işlevlerinin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
12Konu Anlatımı: Bitki hormonları Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Hormonların işlevlerinin örnekler verilerek tartışılması Kısa Sınav 5 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Hormon yapılarının ve hormonların işlevlerinin hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar. Kısa Sınav 5: (Hormonlar) Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
13Konu Anlatımı: Bitki büyüme ve gelişmesinde rol oynayan epigenetik faktörler Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Epigenetik nedir? ve bitkilerdeki etkileri nelerdir? konularının tartışılmasıÇiçeklenme, tohum oluşturma, vb. gibi bitki büyüme ve gelişiminde rol oynayan epigenetik faktörlere ilişkin kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
14Konu Anlatımı: Patojenite ve bitki savunması Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Bitkilerdeki biyotik stres faktörlerinin tartışılması Kısa Sınav 6 (15 dk.): Ders sonunda, derste işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması Biyotik stres faktörleri, bitki savunması ve bitki-patojen evrimi ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar. Kısa Sınav 6: (Fitopatoloji) Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
15Konu Anlatımı: Patojenite ve bitki savunması Sınıf-içi Tartışma (5 dk.): Bitkilerdeki biyotik stres faktörlerinin tartışılmasıBiyotik stres faktörleri, bitki savunması ve bitki-patojen evrimi ile ilgili kavramların hatırlatılması ve etkinleştirilmesi. Kaynak: Ders Kitabı ve Önerilen Kaynaklar.
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım146
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği624
Ödev
Sunum/Jüri
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati143
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması143
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği62
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)115
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)130
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok