| Hafta | Konular | Ön Hazırlık |
|---|
| 1 | Konu Anlatımı: Biyofiziğe giriş, temel kavramlar, canlı sistemlerin temel yapısı. Sunum/Jüri: Sunum çalışmasında araştırabilecekleri konular ve sunum hakkında bilgilendirme. Sınıf-içi Tartışma (10 dk.): Canlı sistemlerin temel yapısı konusunda tartışma. | Biyofiziğin tanımı, kapsamı ve fizik yasalarının canlı sistemlerde nasıl uygulandığına dair temel kavramların gözden geçirilmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 2 | Konu Anlatımı: Atomlar ve moleküllerarası etkileşimler, moleküler bağlar, zayıf etkileşimler. | 1. Atomlar arası güçlü bağlar ve bu bağların fiziksel ve kimyasal özelliklere etkisinin gözden geçirilmesi. 2. Moleküllerarası zayıf etkileşimler ile bu etkileşimlerin biyolojik moleküllerdeki rolünün incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 3 | Konu Anlatımı: Suyun fiziksel ve kimyasal özellikleri, suyun iyonizasyonu, suyun hayat için önemli fizikokimyasal özellikleri, pH’nın organizma düzeyinde düzenlenmesi. | 1. Su molekülünün yapısı, polaritesi, hidrojen bağları ve bu yapıların suyun fiziksel ve kimyasal özelliklerine etkisinin açıklanması. 2. Suyun iyonizasyonu, pH kavramı ve organizmalarda pH’nın tampon sistemlerle nasıl düzenlendiğinin incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 4 | Konu Anlatımı: Proteinlerin yapı taşları, aminoasitlerin asit-baz özellikleri, proteinlerde yapı düzeyleri, tersiyer ve kuaterner yapılar. Kısa Sınav 1 (15 dk.): Ders sonunda, derste bu hafta dahil işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması. | 1. Biyomoleküllerin, özellikle amino asitlerin yapısı ve işlevi hakkında bilgi sahibi olunması, protein yapısının daha iyi anlaşılmasını sağlayacaktır. 2. Kısa Sınav 1: (Proteinlerin yapı taşları, aminoasitlerin asit-baz özellikleri, proteinlerde yapı düzeyleri, tersiyer ve kuaterner yapılar.) Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 5 | Konu Anlatımı: Proteinleri saflaştırmada ve yapı tayininde kullanılan fiziksel yöntemler saflaştırma yöntemleri, molekül büyüklüğüne dayalı yöntemler, gel filtrasyonu kromatografisi, elektrik yüküne dayalı yöntemler. | 1. Protein saflaştırmasının amacı, temel prensipleri ve genel saflaştırma yaklaşımlarının gözden geçirilmesi. 2. Proteinlerin fiziksel özelliklerine (molekül büyüklüğü ve elektrik yükü) dayalı ayırma yöntemlerinin incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 6 | Konu Anlatımı: İyon değişim kromatografisi, elektroforez, izoelektrik çökeltme. | İyon değişim kromatografisi, elektroforez ve izoelektrik çökeltme yöntemlerinin temel prensiplerinin ve ayırma mekanizmalarının incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 7 | Konu Anlatımı: Proteinlerin molekül ağırlığını tayin yöntemleri, molekülün üç boyutlu yapısının belirlenmesi. Kısa Sınav 2 (15 dk.): Ders sonunda, derste bu hafta dahil işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması. | 1. Proteinlerin molekül ağırlığını tayin etmek için kullanılan temel yöntemlerin (SDSPAGE, jel filtrasyonu vb.) çalışma prensiplerinin gözden geçirilmesi. 2. Kısa Sınav 2: (Proteinlerin Molekül Ağırlığını Tayin Yöntemleri, Molekülün Üç Boyutlu Yapısının Belirlenmesi.) Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 8 | Ara Sınav 1 | |
| 9 | Konu Anlatımı: Nükleik asitler- DNA ve RNA, nükleik asitlerin yapıları, DNA molekülü, prokaryotik ve ökaryotik DNA’nın özellikleri, eşleme (replikasyon) kalıtsal bilginin anlatımı (gen ekspresyonu), RNA sentezi, DNA’nın transkripsiyonu (kayıt aşaması). | DNA ve RNA’nın temel yapı taşları (nükleotitler), yapısal özellikleri ve aralarındaki farkların gözden geçirilmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 10 | Konu Anlatımı: Elektrik akımlarının doku üzerindeki etkileri. | Elektrik akımının canlı dokular üzerindeki uyarıcı, iletici ve zararlı etkilerinin; frekans, akım şiddeti ve uygulama süresiyle ilişkili olarak incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 11 | Konu Anlatımı: Hücre membranın biyofiziksel özellikleri, elektriksel eşdeğer devreler ve modeller. Kısa Sınav 3 (15 dk.): Ders sonunda, derste bu hafta dahil işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması. | 1. Hücre membranının yapısı, iyon geçirgenliği ve seçicilik gibi temel biyofiziksel özelliklerinin incelenmesi. 2. Hücre membranının elektriksel davranışının direnç ve kapasitans kavramlarıyla modellenmesi; basit eşdeğer devre modellerinin anlaşılması. 3. Kısa Sınav 3: (Hücre membranın biyofiziksel özellikleri, elektriksel eşdeğer devreler ve modeller.) Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 12 | Konu Anlatımı: Biyoenerjetik açıdan moleküllerin membrandan iletisi. | 1. Pasif ve aktif taşıma mekanizmalarının temel farklarının ve enerji gereksinimlerinin incelenmesi. 2. Taşıma sırasında kullanılan enerji formlarının ve bu enerjinin membran potansiyeliyle ilişkili olarak değerlendirilmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 13 | Konu Anlatımı: Görme biyofiziği. | 1. Işığın fiziksel özelliklerinin ve mercekler aracılığıyla görüntü oluşumunun temel ilkelerinin gözden geçirilmesi. 2. Gözün optik sistemi üzerinden geçen ışığın retinada odaklanmasını açıklayan fiziksel prensiplerin incelenmesi. Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 14 | Konu Anlatımı: İşitme biyofiziği. Kısa Sınav 4 (15 dk.): Ders sonunda, derste bu hafta dahil işlenen konuları içeren bir kısa sınavın yapılması. | 1. Sesin fiziksel özellikleri ve ses dalgalarının havadaki yayılım prensiplerinin gözden geçirilmesi. 2. Kısa Sınav 4: Görme biyofiziği, işitme biyofiziği) Kaynak: Ders kitabı ve zorunlu kaynaklar. |
| 15 | Konu Anlatımı: Sunum/Jüri (Seçilen ve araştırılan konular ile ilgili öğrenci sunumları). Sınıf-içi Uygulama: Sunum/Jüri: Seçilen ve araştırılan konular ile ilgili öğrenci sunumları. Sınıf-içi Tartışma: Öğrenci sunumları ile ilgili tartışma. | |
| 16 | Final | |
