Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Hücre Sinyal İletim MekanizmalarıKIM5740 37.5300
ÖnkoşullarYok
YarıyılGüz, Bahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiDoktora
Dersin TürüSeçmeli @ Kimya ABD Biyokimya Doktora Programı
Ders KategorisiTemel Meslek Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimKimya Bölümü
Dersin KoordinatörüAyşegül PEKSEL
Dersi Veren(ler)Ayşegül PEKSEL
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıBu derste öğrencilere, hücre içi sinyal iletim mekanizmaları, hücre içi sinyalizasyonda görev alan farklı tipteki reseptörler ve sinyalizasyon yolaklarının (G proteinleri, efektör enzimler, iyon kanalları, hücre içi kalsiyum, fosfolipazlar ve eikozanoidler, protein kinazlar, protein fosforilasyonu vb.) fonksiyonel özellikleri, hedef hücre yanıtlarının düzenlenmesine aracılık eden mekanizmalar, hücre içi sinyal iletiminin fizyolojik işlevleri (apoptozis, hücre siklusu regülasyonu, gen transkripsiyonu vb.) ve klinik önemi (kanser, kardiyovasküler hastalıklar, öğrenme ve hafıza, immün cevaplılık vb.) konularında genel bir bakış açısı ve anlayış kazandırmak amaçlanmıştır. Bu konularda bilgi sahibi bireylerin yetiştirilmesi temel hedeflerdendir.
Dersin İçeriği1.Hücre sinyal iletim mekanizmaları 2.Sinyal iletiminde görev alan moleküller • G proteinleri • Efektör enzimler • İyon kanalları • Hücre içi kalsiyum • Fosfolipazlar ve eikozanoidler • Protein kinazlar ve protein fosforilasyonu 3.Hücre yüzey reseptörleri 4.Hücre yüzey reseptörleri ve hücre içi sinyal yolları • Hücre yüzey reseptör çeşitleri • Ligand molekül çeşitleri • İyon kanalları ve nörotransmitterler • İyon pompaları ve mekanizmaları 5.Sinyalizasyon yolaklarının fonksiyonel özellikleri 6.Sitoplazmik sinyal iletim yolakları • Sitoplazmik ikincil habercilerin çeşitleri • İkincil habercilerin iletim yolağındaki rolleri • cAMP ve cGMP yolağı • Kalsiyum ve kalmodulin moleküllerinin hücre içindeki görevleri 7.Hedef hücre yanıtlarının düzenlenmesine aracılık eden mekanizmalar 8.Hücre çoğalmasını kontrol eden sinyal yolakları • Ras sinyal yolağı • ERK / MAP kinaz yolağı 9.Sinyal iletiminin fizyolojik işlevleri • Yaşlanma ve telomeraz, • Apoptoz veya programlı hücre ölümü • Proteolitik mekanizmalar 10.Sinyal iletimi ve klinik önemi • Kanser • Kardiyovasküler hastalıklar • Öğrenme ve hafıza • İmmun yanıt
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • D.L. Nelson, M.M.Cox, Lehninger Principles of Biochemistry, Worth Publisher, 6th Edition, 2013.
  • D. Batien et al. Signal Transduction, Elsevier Academic Press, 2005.
  • J.W. Wang and R. Casero, Cell Signalling. Physiology, Pharmacology and Cancer Research. Humana Press, 2006.
  • B.D. Gomperts et. al., Signal Transduction, 2nd Edition, Elsevier Academic Press, 2009.
  • Konular ile ilgili özgün makale ve derlemeler (www.pubmed.com, vs.)
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenciler, bu ders ile ilk aşamada hücrede sinyal iletimini öğrenecek, sinyal tiplerini ve farklı sinyal moleküllerinin moleküler niteliklerini tanıyacaklardır.
  2. Farklı sinyal yolaklarını detaylı bir şekilde ele alacak ve bu yolaklardaki sapmaların neden olduğu hastalıkları öğreneceklerdir.
  3. Farklı sinyal yolakları ve farklı hastalıklar arasındaki ilişkileri öğrenerek dolayısı ile kendi araştırmalarını, bu dersten edindikleri bilgilere dayandırarak tasarlayabilecek ve araştırmalarında elde ettiği sonuçları yorumlayabilecektir.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Sinyal iletimine girişDers Kitabı, Bölüm 1
2Hücre sinyal iletim mekanizmalarıDers Kitabı, Bölüm 2
3Sinyal iletiminde görev alan moleküllerDers Kitabı, Bölüm 3
4Sinyal iletiminde görev alan moleküllerDers Kitabı, Bölüm 3
5Hücre yüzey reseptörlerine bağlanan hücre sinyal molekülleriDers Kitabı, Bölüm 3
6Hücre yüzey reseptörleri ve hücre içi sinyal yollarıDers Kitabı, Bölüm 3,4
7Sinyalizasyon yolaklarının fonksiyonel özellikleriDers Kitabı, Bölüm 4
8Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı
9Ara Sınav 1Ders Kitabı, Bölüm 4
10Hedef hücre yanıtlarının düzenlenmesine aracılık eden mekanizmalarDers Kitabı, Bölüm 5
11Hücre çoğalmasını kontrol eden sinyal yolaklarıDers Kitabı, Bölüm 6
12Sinyal iletiminin fizyolojik işlevleri Ders Kitabı, Bölüm 7
13Sinyal iletimi ve klinik önemi (Kanser)Ders Kitabı, Bölüm 8
14Sinyal iletimi ve klinik önemi (Kardiyovasküler hastalıklar, öğrenme ve hafıza, immun yanıt)Ders Kitabı, Bölüm 8
15Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım130
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar140
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati133
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması137
Derse Özgü Staj
Ödev122
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer122
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)125
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)125
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok