Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Protein MühendisliğiMBG406224200
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin DiliTürkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Moleküler Biyoloji ve Genetik Lisans Programı
Ders KategorisiUzmanlık/Alan Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimMoleküler Biyoloji ve Genetik Bölümü
Dersin KoordinatörüEmel Ordu
Dersi Veren(ler)Emel Ordu
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıTıp ve biyoteknoloji alanlarında kullanım amacıyla modifiye edilmiş proteinlerin tasarlanmasına temel oluşturacak protein yapı ve fonksiyon kavramlarının anlaşılması
Dersin İçeriğiProtein katlanması, dayanıklılığı ve fonksiyonu, istenilen amaca yönelik olarak protein yapı, fonksiyon ve dayanıklılığı değiştirilmiş mutantların geliştirilmesi, protein mühendisliği metodları.
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
  • Protein Structure, Stability and Folding, Kenneth P. Murphy, Humana Pres, 2001.
  • Protein Engineering, Volume 388 (Methods in Enzymology), Dan Robinson, Academic Press; 1 edition, 2004.
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Öğrenci protein yapısının genel özelliklerinin, ikincil yapıların, motifler ve klasik 3 boyutlu yapını kavrar.
  2. Öğrenci Protein mühendisliği Rasyonel Dİzayn yaklaşımı hakkında bilgi sahibi olur
  3. Öğrenci Protein mühendisliği Yönlendirilmiş Evrim yaklaşımı hakkında bilgi sahibi olur
  4. Öğrenci Protein Mühendisliği laboratuar uygulama tekniklerin hakkında bilgi sahibi olur.
  5. Öğrenci proteinlerin geliştirilmesinde protein mühendisliği yöntemlerinin kullanımı hakkında bilgi sahibi olur.

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Protein Yapısının Genel Özellikleri, amino asitler, peptid bağıDers Kitabı 1
2Protein Yapısının Genel Özellikleri, İkincil yapılar, Motifler ve Klasik 3 Boyutlu Protein YapısıDers Kitabı 1
3Protein Katlanması mekanizmalarıDers Kitabı 1
4Protein StabilitesiDers Kitabı 1
5Protein Mühendisliğinin Tanımlanması. İstenilen Özellikte Rekombinant Proteinlerin Geliştirilmesi.Ders Kitabı 1
6Protein Mühendisliği Yaklaşımları, Rasyonel Dizayn Ders Kitabı 1
7Moleküler Modelleme, Homoloji modellemeDers Kitabı 1
8Ara Sınav 1 / Uygulama veya Konu Tekrarı
9Protein Mühendisliği Yaklaşımları, Yönlendirilmiş MutasyonDers Kitabı 1
10Yönlendirilmiş Mutasyon yöntemleri ErorProne PCR, DNA Shuffling, Family DNA ShufflingDers Kitabı 2
11Protein Mühendisliği Yaklaşımları, Yarı Rasyonel Dİzayn, bölge doygunluk mutasyonuDers Kitabı 2
12Protein Stabilitesinin Geliştirilmesinde Kullanılan MetodlarDers Kitabı 2
13Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Güncel makale araştırmasıAraştırma makaleleri
14Örnek Bir Proteinin Protein Mühendisliği Yöntemleri ile Geliştirilmesi. Güncel makale araştırmasıAraştırma makaleleri
15Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev110
Sunum/Jüri110
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar140
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati142
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması141
Derse Özgü Staj
Ödev110
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer110
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)140
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok