Anasayfa » Akademik Birimler » Kimya-Metalurji Fakültesi » Biyomühendislik Bölümü » Dersler » Sistem Biyolojisinin Prensipleri
Ders AdıKodu Yerel KrediAKTS Ders (saat/hafta)Uygulama (saat/hafta)Laboratuar (saat/hafta)
Sistem Biyolojisinin PrensipleriBYM336235300
ÖnkoşullarYok
YarıyılBahar
Dersin Diliİngilizce, Türkçe
Dersin SeviyesiLisans
Dersin TürüSeçmeli @ Biyomühendislik Lisans Programı (%30 İngilizce)
Ders KategorisiTemel Meslek Dersleri
Dersin Veriliş ŞekliYüz yüze
Dersi Sunan Akademik BirimBiyomühendislik Bölümü
Dersin KoordinatörüSelcen Arı Yuka
Dersi Veren(ler)Selcen Arı Yuka
Asistan(lar)ı
Dersin AmacıSistem bileşenlerinin omik veri düzeyinde anlaşılması. Öğrencilerin genomik, transkriptomik, proteomik ve metabolomik yaklaşımlar hakkında bilgi edinmesi Temel omik veri elde etme ve işleme metodlarının öğrenilmesi Omik verinin translasyonel uygulamalarda kullanımının anlaşılması
Dersin İçeriğiOmik veri toplama ve yorumlama, Sistem biyolojisi araştırmalarında kullanılan temel veri türleri, Sistem biyolojisi yaklaşımlarında omik veri işlemesi, Ağ Biyolojisi, Topolojik parametreler, Biyoinformatik araçlara dayalı pratik çalışmalar
Ders Kitabı / Malzemesi / Önerilen Kaynaklar
Opsiyonel Program BileşenleriYok

Ders Öğrenim Çıktıları

  1. Sistem bazlı analizler ve yüksek hacimli verilerle ilgili temel bilgiye sahip olmak
  2. Omik veri eldesinde kullanılan deneysel teknikleri ve hesapsal analiz yöntemlerinin öğrenilmesi
  3. Durum çalışmalarının yardımı ile sistem biyolojisi uygulamalarına aşina olmak
  4. Sistem biyolojisi, ağ biyolojisi, topoloji, metabolik model gibi tanımların öğrenilmesi
  5. Sistem biyolojisi uygulamaları ile translasyonel uygulamalar geliştirmek

Ders Öğrenim Çıktısı & Program Çıktısı Matrisi

DÖÇ-1DÖÇ-2DÖÇ-3DÖÇ-4DÖÇ-5
PÇ-1-----
PÇ-2-----
PÇ-3-----
PÇ-4-----
PÇ-5-----
PÇ-6-----
PÇ-7-----
PÇ-8-----
PÇ-9-----
PÇ-10-----
PÇ-11-----
PÇ-12-----
PÇ-13-----
PÇ-14-----
PÇ-15-----
PÇ-16-----
PÇ-17-----
PÇ-18-----
PÇ-19-----
PÇ-20-----
PÇ-21-----
PÇ-22-----
PÇ-23-----
PÇ-24-----
PÇ-25-----
PÇ-26-----
PÇ-27-----
PÇ-28-----
PÇ-29-----
PÇ-30-----

Haftalık Konular ve İlgili Ön Hazırlık Çalışmaları

HaftaKonularÖn Hazırlık
1Derse GirişDers Notları ve önerilen kaynaklar
2Biyolojik moleküller: Genler, proteinler, metabolitlerDers Notları ve önerilen kaynaklar
3Sistem Biyolojisinin TemelleriDers Notları ve önerilen kaynaklar
4Sistem biyolojisinde araçlar ve veri tabanlarıDers Notları ve önerilen kaynaklar
5Omik Veriler: Genomik ve TranskriptomikDers Notları ve önerilen kaynaklar
6Omik Veriler: Proteomik ve MetabolomikDers Notları ve önerilen kaynaklar
7Yeni nesil dizileme omik veri analiziDers Notları ve önerilen kaynaklar
8Ara Sınav 1
9Ağ biyolojisi-1Ders Notları ve önerilen kaynaklar
10Ağ biyolojisi-2Ders Notları ve önerilen kaynaklar
11Diferansiyel Gen ifadesi analiziDers Notları ve önerilen kaynaklar
12Fonksiyonel zenginleştirme ve Protein-protein etkileşim analizleriDers Notları ve önerilen kaynaklar
13Translasyonel uygulama örneği- İlaç yeniden konumlandırma ve yapısal biyolojiDers Notları ve önerilen kaynaklar
14Proje Sunumları
15Proje Sunumları
16Final

Değerlendirme Sistemi

EtkinliklerSayıKatkı Payı
Devam/Katılım13
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Derse Özgü Staj
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Ödev
Sunum/Jüri130
Projeler
Seminer/Workshop
Ara Sınavlar130
Final140
Dönem İçi Çalışmaların Başarı Notuna Katkısı
Final Sınavının Başarı Notuna Katkısı
TOPLAM100

AKTS İşyükü Tablosu

EtkinliklerSayıSüresi (Saat)Toplam İşyükü
Ders Saati133
Laboratuar
Uygulama
Arazi Çalışması
Sınıf Dışı Ders Çalışması135
Derse Özgü Staj
Ödev
Küçük Sınavlar/Stüdyo Kritiği
Projeler
Sunum / Seminer
Ara Sınavlar (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)215
Final (Sınav Süresi + Sınav Hazırlık Süresi)120
Toplam İşyükü :
Toplam İşyükü / 30(s) :
AKTS Kredisi :
Diğer NotlarYok